A testület a határozat alapján javaslatokat tesz, véleményez és tanácsadói feladatokat is ellát. A GMO Munkacsoport vezetőjét a vidékfejlesztési miniszter, 6 tagját pedig a közigazgatási-, a belügy-, a külügy-, a nemzeti erőforrás, a nemzeti fejlesztési illetve a nemzetgazdasági miniszter delegálja.

A Munkacsoport koordinálja a genetikailag módosított élőlényektől mentes mezőgazdaságra vonatkozó rendelkezések végrehajtását, valamint segíti a jogsértés esetén megállapítható, büntetőjogi felelősséget is tartalmazó szankciórendszer, illetve speciális kártérítés kidolgozását és az ezekhez szükséges tárcaközi egyeztetéseket.

A munkacsoport tagjai a határozat szerint díjazásban nem részesülnek.